12月30日，我院组织开展了一场以“TCGA及GEO数据库简介及分析策略”为题的学术讲座。此次讲座由贵州省人民医院宋具昆博士主讲，全院青年医（教）师以及研究生参会学习。研究生科研管理科副科长谭旭主持讲座。
讲座中，宋具昆从多年来自己撰写高质量论文的经历中总结经验，向参会人员介绍了“The Cancer Genome Altas 数据库（TCGA数据库）”“Gene Expression Omnibus 数据库（GEO数据库）”及其使用教程和操作系统等方面内容。讲座真实生动、贴合基础研究与临床需求，适合我院实际情况。参会教师、医务人员和各年级研究生反响良好，尤其是讲座中详细介绍了数据库对科研研究的重要作用，使研究生和我院教职工受益匪浅。
此次讲座扩大了参会人员眼界，开阔了他们的科研思维，也给临床研究提供了一种新思路。讲座结束后，宋具昆博士逐一回答了大家提出的问题，与我院青年医（教）师及研究生进行了面对面交流，对我院科研发展起到了积极作用。
延伸阅读
宋具昆，男，博士研究生，副主任医师，硕士研究生导师。2003年毕业于遵义医学院口腔医学系，2006年研究生毕业于四川大学华西口腔医学院口腔颌面外科专业，后进入贵州省人民医院口腔科工作，一直从事口腔颌面外科临床工作，并于2013年晋升副主任医师。熟悉循证医学、生物信息学、临床预测模型、影像组学及单细胞、空间转录组学等，对很多公共数据库如seer数据库、Nhanes数据库及Mimic重症医学数据库挖掘有一定的造诣，能熟练应用R软件、stata软件、endnote软件、Cytoscape软件及SPSS等软件进行各种meta分析，如剂量反应的meta分析、基因多态性的meta分析及网络meta分析；能从TCGA、GEO和GTEx芯片数据库下载基因芯片数据，用R语言做差异分析，绘制火山图、热图；能熟练应用高级生物信息学方法如WGCNA及风险模型建立（risk model），用R语言做GO及KEGG分析以及用R语言做生存分析，绘制nomogran图及lasso回归筛选重要变量；能做竞争风险模型及PSM评分，初步了解机器学习方法如随机森林，神经网络等方法。以第一作者及通讯作者发表SCI文章30篇，累计影响因子70分左右，中文核心期刊3篇，参与国自然课题一项，主持贵州科技厅基础项目1项，贵州省卫建委项目1项。
来源 | 研究生科研管理科
作者 | 吴海军
编辑 | 姜文文
排版 | 姜文文
一审 | 廖 健
二审 | 唐正龙
三审 | 宣传科
四审 | 张军梅
